君主制国家威斯帕尼亚王国因发现奇妙的矿石而引起世界关注,然而此时却发生悲惨事件. 威斯帕尼亚王国女王萨克拉·阿尔蒂亚和王子吉尔·加乌尔突发意外身亡.公主米拉·朱丽叶拒绝继承王位,与此同时国内也掀起反对米拉合要求取消君主制的狂潮. 在这种纷乱的情况下,米拉和奇斯伯爵出访日本.在公主的欢迎宴会上,米兰险遭暗算,无法忍受这一切的她偷偷逃了出去,却在日本街头遭遇与自己长相一样的小兰,渴望正常人生活的米拉于...

位于东京的东都线地铁开通当日，一起针对东京都知事朝仓优一郎的炸弹袭击事件爆发，导致东都线列车损毁。经过一番推理，柯南（高山みなみ 配音）等人认定这与8年前朝仓主持负责的北之泽水坝的修建有关。当年为了修建大坝，朝仓动员北之泽村的人民搬入新村，可是仍有许多人反抗到最后阶段。为了探明真相，柯南、灰原（林原めぐみ 配音）、少年侦探团以及毛利小五郎（小山力也 配音）等人开赴白雪皑皑的北之泽。在这片纯净的雪国...

晴朗时节，江户川柯南（高山南 配音）和毛利小五郎（小山力也 配音）、小兰（山崎和佳奈 配音）以及少年侦探团的伙伴们一同来到京都，他们即将登上自卫队的宙斯盾战舰，体验一把出海作战的感觉，期间还结识了美丽又有着几分神秘的女自卫队员藤井七海（柴咲幸 配音）。谁知快乐的氛围很快被恐慌所替代，战舰上突然发现一条断掉的手臂，消失的自卫队员又引起军方的恐慌与猜测。原来某国神秘间谍X已悄悄登上宙斯盾，伺机盗取战舰...